É professora titular de Cirurgia da Faculdade de Medicina da Universidade de São Paulo (FMUSP), onde também se formou e fez mestrado e doutorado. Na mesma faculdade, foi chefe do Departamento de Gastroenterologia, e no Hospital das Clínicas da USP, criou a Disciplina de Coloproctologia. Habr-Gama fundou e preside a Associação Brasileira de Prevenção do Câncer de Intestino (Abrapreci). É a primeira mulher e a primeira pessoa formada em Medicina na América Latina a integrar o grupo de Membros Honorários da European Surgical Association, em 2006. Também é Membro Honorário da sociedade científica American Surgical Association desde 2002.